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要关闭拼多多商家版的短信自动充值功能，可以按照以下步骤操作。
1、登录拼多多商家版账号，进入后台管理界面。
2、在后台管理界面找到“账户资金”或“短信服务”等相关选项。
3、在这些选项中，找到“短信自动充值”功能。
4、点击关闭或取消自动充值功能的相关选项。
如果在操作过程中遇到困难，可以联系拼多多商家客服进行咨询，获取更具体的指导，需要注意的是，不同的拼多多商家版应用或版本可能存在操作上的差异，以上方法仅供参考，具体以实际情况为准，关闭自动充值功能后，需要留意短信充值的余额和有效期，避免因为未及时充值而影响店铺的正常运营。